للمجمع مكتبة غنية بالكتب والمراجع والموسوعات في اللغة والآداب والعلوم والفنون المختلفة التي ازدانت بها بالشراء والإهداء واقتناء المطبوعات النفيسة في جميع فروع المعرفة؛ فبها من الكتب والمراجع والمعاجم حوالي خمسين ألف مجلد ما بين عربي وأجنبي وما لغوي وعلمي وما بين مطبوع أو مخطوط أو مصور. وقد عنى بتصنيفها تصنيفا عشريًّا، وفهرستها حسب الموضوع وعنوان الكتاب واسم المؤلف، وبالمكتبة أيضًا كثير من كتب التراث الأساسية في التفسير وعلوم القرآن والحديث والفقه والتصوف والفلسفة والمنطق واللغة والنحو والصرف وكذلك تختلف فروع العلوم الأساسية والعلوم التطبيقية، غير المئات من أمهات الكتب والمعاجم والعلوم القديمة والحديثة والفنون وغيرها.

ويرجو المجمع أن يتمكن قريبا من رفع بيانات هذه الكتب والمراجع على الشبكة العالمية وإتاحتها لجمهور الباحثين ضمن خطة التطوير التي يتبناها حاليا.